近几年的优生遗传研究证实，部分中草药对孕妇及胎儿有不良影响。中草药中的红花、积实、蒲黄、麝香等，具有兴奋子宫的作用，易导致宫内胎儿缺血缺氧，甚至弓{起流产、早产。大黄、芒硝、大戟、商陆、巴豆、芫花、牵牛子、甘遂等中草药，可通过刺激肠道，反射性引起子宫强烈收缩，从而导致流产、早产。有些中草药本身就具有一定的毒性，如斑蝥、生南星、附子、乌头、一枝蒿、川椒、蜈蚣、甘遂、芫花、朱砂、雄黄、大戟、商陆、巴豆等，所含的各种生物碱及化学成分十分复杂，可直接或间接影响胎儿的生长发育。
在怀孕最初3个月内，除慎用西药外，中草药亦应慎用，以免造成畸胎。对含上述中草药的中成药也应警惕，避免服用。当然，孕妇患病也应及时治疗，勿讳疾忌医。在就诊时向医生说明自己已怀孕，请医生权衡利弊，尽量选择安全无不良反应的药物。