过去怀孕期如果出现胎儿疾病是没有办法治疗的，随着医学水平的提高，治疗婴儿疾病已经变成现实。当然不是每种胎儿疾病都可以进行宫内治疗。
当孕妈妈腹中的胎儿为单卵双胞胎时，由于两个胎儿的血压高于另一个，结果就可能一个血液过多不堪负担，一个贫血，两败俱伤。可在胎儿镜下电凝血管或脐带血管结扎，切断相连的血管，治疗输血综合征，其成功率已达60%。在图像胎儿镜的引导下，可以对胎儿进行输血、造血、细胞移植或基因治疗。就对子宫刺激而言，胎儿镜手术比子宫切开手术明显减少，早产和流产离也下降。宫内治疗已广泛用于围产儿疾病的预防和控制。药物进入胎儿体内有三条途径：通过脐血管穿刺将药物直接注入羊膜腔让胎儿通过吞咽吸收药物；母体应用药物通过胎盘进入胎儿血液循环。通过母体间接给药的应用最早，已积累不少经验，比如治疗胎儿宫内生长迟缓、预防新生宝宝呼吸窘迫综合征、早产儿颅内出血、胎儿宫内感染等。
母子血型不合时，导致母体产生抗红细胞抗体，会破坏胎儿的红细胞，引起胎儿严重的溶血性疾病（贫血、胎儿水肿或积水等）。患病严重都可在妊娠18～20周即发展为胎儿水肿，甚至死亡。另外，还会引起新生宝宝胆红素脑病等，导致少儿智力障碍。胎儿宫内输血能阻止胎儿水肿的发生和降低疾病的严重程度及死亡率。当胎儿血细胞比容低于30%就需要胎儿宫内输血。根据孕龄、胎儿贫血程度、胎儿重量及输入后希望达到的血细胞比容计算其输入量，一般在20～120毫升之前。初次输血可选择在妊娠26周开始，通常每隔2～4周可进行一次，直到34～36周。