卵子受精开始的7日内，在受精卵着床于子宫内膜前的这段时期为着床前期。此期的受精卵尚在输卵管腔或子宫体腔的分泌液中运行，孕妇在着床前期用药对胚胎的影响极小，其必备条件是药物必须进入分泌液中一定数量方能起作用，若药物对胚胎毒性极强，可以造成早期流产。
受精后8～14日之内，因着床时间不长，胚胎组织尚未分化，不致发生畸形，药物影响绝大多数以流产告终。
受精后15～41日（相当于末次月经第1日后的29～55日），这段时间，正是胚胎各脏器、器官分化发育时期，胎儿胎盘循环已经建立，此时孕妇用药极易通过胎盘进入胚胎体内，干扰胚胎组织细胞的正常分化，任何一群细胞受到药物干扰，均可能陷入胚胎其他部分不相应的分化时相，若胚胎继续发育，则可能使某一脏器或器管发生形态结构异常，导致畸形的发生，故药物的致畸作用常是由于妊娠前2个月孕妇用药产生的。这一时期被认为是药物致畸的敏感期，此时期用药应非常慎重。药物致畸作用既可以在新生儿出生时见到，也可以在生后一段时期后才显现。
妊娠早期，已知孕妇用抗肿瘤药、抗癫痫药、乙烯雌酚、糖皮质激素、水杨酸、四环素、硝咪唑类药，有可能导致胎儿畸形。对实验动物具有致畸作用的某些药物，虽尚无对人类临床致畸的报道，也以尽可能不用为好。