从妊娠第9周至妊娠足月期间，是胎儿生长、器官发育、功能逐渐完善的阶段，仅神经系统、生殖器官和牙齿仍在继续分化，尤其是神经系统的分化发育直至妊娠末期还在进行。当受到药物的有害作用后，由于胎儿肝功能尚不完善和血脑屏障易于通过，极易使胎儿神经系统受到损害。
药物对胎儿的影响，包括引起胎儿宫内发育迟缓或某些器官发育不良而致功能缺陷、行为异常等。下列药物对胎儿期有不良影响，应禁用：
1 四环素妊娠中期以后应用，可致牙齿黄染、牙釉质发育不全、骨生长迟缓、小肢畸形等。
2 氯霉素会在肝内与葡萄糖醛酸结合解毒，再经过肾排出。但是由于胎肝内酶系统还不健全，肾排泄的功能比较差，容易在胎儿体内蓄积，发生“灰婴综合征”。
3 链霉素可致第8对脑神经（听神经）和肾损害，造成先天性耳聋和前庭功能障碍。
4 碘胺类药碘胺与胎儿血中胆红素竞争蛋白结合部分，使结合胆红素减少，游离胆红素增多，易发生胆红素性脑病出现核黄疸的危险。
5 苯妥英钠可致胎儿苯妥英钠综合征（颅面及肢体畸形、出血倾向及智力低下等）。
6 降压药利血平可导致胎儿心脏跳动过缓，甲基多巴可致胎儿在宫内发育的比较迟缓。
7 前列腺素合成抑制剂吲哚美辛（消炎痛）可致胎儿出血倾向，胎儿动脉导管过早关闭而出现肺动脉高压。
8 抗甲状腺药硫氧嘧啶、甲巯咪唑（他巴唑）可抑制胎儿甲状腺功能，产生甲状腺功低下并使用状腺肿大。
9 口服抗血凝药双香豆素、双香豆素乙酯、华法林容易通过胎盘屏障，引起胎儿凝血酶原不足，导致死胎。故妊娠最后4周禁用。若必须应用抗血凝药，应选用大分子、不易通过胎盘的肝素。
10 疫苗如风疹疫苗、麻疹活疫苗有导致风疹病毒、麻疹病毒感染的危险，故在胎儿期禁用。