每年9月份左右注射的流感疫苗只预防流行性感冒即流感，对普通的感冒没有作用。流感与普通感冒有区别。流行性感冒是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病，病原体分为甲、乙、丙三型病毒，毒力依次减弱。甲型流感病毒易引起世界性打流行；乙型流感病毒常引起局部暴发；丙型流感病毒以散发为主，主要侵袭婴幼儿。普通感冒是一种急性上呼吸道感染，不具有流行性，由多种病原体所致，一年四季均可发病。它的病原体可以是病毒，也可以是细菌或支原体。流感的潜伏期一般为1～3天，起病急，伴高热，体温可达39～40℃，可持续数天，畏寒、头疼、乏力、全身酸痛等全身症状较重，少数患者有鼻出血、食欲不振、恶心、便秘或腹泻等轻度胃肠道症状。流感发病季节在冬春季，具有传染性和流行性，病死率很高，特别是婴幼儿和老年人，因此建议这些人群每年都要接种流感疫苗。而普通的感冒即上呼吸道感染起病较缓慢，症状较轻，无明显中毒症状，而且一年四季均有发病。
由于流行性感冒与普通感冒存在差异，流感疫苗只用于流感的预防，因此接种流感疫苗自然不能预防普通感冒。另外，即便接种了流感疫苗也不能永久预防流感的发生，流感病毒表面抗原具有变异性，容易形成新变种。正因为这种不断地变异，WHO每年都要召开一次年会，根据流行趋势，推荐流感疫苗株，生产新疫苗，以适应变异的流感毒株。因此，每年需注射新的流感疫苗预防流感。如果流行的流感病毒与疫苗病毒型别不同，仍有可能感染流感。